甘肃省白龙江林业信息中心隶属于甘肃省白龙江林业保护中心，正县级建制。2021年8月，按照保护中心党委《关于部分直属事业单位更名的通知》（白林党发（2021）67号）精神，甘肃省白龙江林业管理局信息化管理中心正式更名为甘肃省白龙江林业信息中心。

甘肃省白龙江林业信息中心内设机构由党的内设机构、基层组织和行政科室组成。分别为党委办公室、机关党支部、综合管理科党支部、离退休党支部、共青团支部、工会、办公室、财务科、综合管理科。

甘肃省白龙江林业信息中心主要职责为：负责协调保护中心在两水地区各项事务和对外联络工作；负责保护中心在两水地区公务接待、后勤保障工作；负责代管保护中心部分档案；负责离退休干部各项保险业务办理及日常服务等工作；负责对陇南鑫林物业管理有限责任公司的监管。